Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid1ip1Q9CQ20 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mid1ip1Q9CQ20 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mid1ip1Q9CQ20 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mid1ip1Q9CQ20 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1ip1Q9CQ20 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mid1ip1Q9CQ20 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1ip1Q9CQ20 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mid1ip1Q9CQ20 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1ip1Q9CQ20 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1ip1Q9CQ20 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid1ip1Q9CQ20 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid1ip1Q9CQ20 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid1ip1Q9CQ20 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms