Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gtf2a1Q99PM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2a1Q99PM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2a1Q99PM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf2a1Q99PM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2a1Q99PM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtf2a1Q99PM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf2a1Q99PM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2a1Q99PM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf2a1Q99PM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf2a1Q99PM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2a1Q99PM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf2a1Q99PM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gtf2a1Q99PM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2a1Q99PM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2a1Q99PM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2a1Q99PM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2a1Q99PM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2a1Q99PM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf2a1Q99PM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf2a1Q99PM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf2a1Q99PM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2a1Q99PM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf2a1Q99PM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2a1Q99PM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2a1Q99PM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2a1Q99PM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2a1Q99PM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2a1Q99PM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf2a1Q99PM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms