Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Bco2Q99NF1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Bco2Q99NF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Bco2Q99NF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Bco2Q99NF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Bco2Q99NF1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Bco2Q99NF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Bco2Q99NF1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Bco2Q99NF1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Bco2Q99NF1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Bco2Q99NF1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Bco2Q99NF1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Bco2Q99NF1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Bco2Q99NF1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Bco2Q99NF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Bco2Q99NF1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bco2Q99NF1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bco2Q99NF1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bco2Q99NF1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Bco2Q99NF1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Bco2Q99NF1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Bco2Q99NF1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Bco2Q99NF1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Bco2Q99NF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Bco2Q99NF1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Bco2Q99NF1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Bco2Q99NF1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Bco2Q99NF1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Bco2Q99NF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Bco2Q99NF1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Bco2Q99NF1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bco2Q99NF1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bco2Q99NF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Bco2Q99NF1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Bco2Q99NF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Bco2Q99NF1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bco2Q99NF1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bco2Q99NF1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Bco2Q99NF1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Bco2Q99NF1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
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