Protein–RNA interactions for Protein: Q99M85

Scrt1, Transcriptional repressor scratch 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scrt1Q99M85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scrt1Q99M85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scrt1Q99M85 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scrt1Q99M85 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scrt1Q99M85 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scrt1Q99M85 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scrt1Q99M85 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scrt1Q99M85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scrt1Q99M85 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scrt1Q99M85 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scrt1Q99M85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scrt1Q99M85 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scrt1Q99M85 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scrt1Q99M85 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scrt1Q99M85 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scrt1Q99M85 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scrt1Q99M85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scrt1Q99M85 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scrt1Q99M85 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scrt1Q99M85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scrt1Q99M85 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scrt1Q99M85 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scrt1Q99M85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scrt1Q99M85 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scrt1Q99M85 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scrt1Q99M85 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms