Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajb11Q99KV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajb11Q99KV1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb11Q99KV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajb11Q99KV1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb11Q99KV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajb11Q99KV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajb11Q99KV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajb11Q99KV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajb11Q99KV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajb11Q99KV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnajb11Q99KV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb11Q99KV1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb11Q99KV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb11Q99KV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb11Q99KV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb11Q99KV1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb11Q99KV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajb11Q99KV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dnajb11Q99KV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajb11Q99KV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajb11Q99KV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajb11Q99KV1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajb11Q99KV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajb11Q99KV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajb11Q99KV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnajb11Q99KV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms