Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Emc3Q99KI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Emc3Q99KI3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Emc3Q99KI3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Emc3Q99KI3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Emc3Q99KI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Emc3Q99KI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Emc3Q99KI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emc3Q99KI3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Emc3Q99KI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Emc3Q99KI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Emc3Q99KI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emc3Q99KI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Emc3Q99KI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Emc3Q99KI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Emc3Q99KI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Emc3Q99KI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Emc3Q99KI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Emc3Q99KI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Emc3Q99KI3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Emc3Q99KI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Emc3Q99KI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Emc3Q99KI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emc3Q99KI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emc3Q99KI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Emc3Q99KI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Emc3Q99KI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Emc3Q99KI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emc3Q99KI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emc3Q99KI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emc3Q99KI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emc3Q99KI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emc3Q99KI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emc3Q99KI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199 ms