Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nrbp1Q99J45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nrbp1Q99J45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nrbp1Q99J45 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nrbp1Q99J45 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nrbp1Q99J45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nrbp1Q99J45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nrbp1Q99J45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nrbp1Q99J45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nrbp1Q99J45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nrbp1Q99J45 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nrbp1Q99J45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nrbp1Q99J45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nrbp1Q99J45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nrbp1Q99J45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nrbp1Q99J45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nrbp1Q99J45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Nrbp1Q99J45 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nrbp1Q99J45 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nrbp1Q99J45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nrbp1Q99J45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nrbp1Q99J45 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nrbp1Q99J45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nrbp1Q99J45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nrbp1Q99J45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nrbp1Q99J45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nrbp1Q99J45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nrbp1Q99J45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nrbp1Q99J45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nrbp1Q99J45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nrbp1Q99J45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nrbp1Q99J45 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Nrbp1Q99J45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrbp1Q99J45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nrbp1Q99J45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nrbp1Q99J45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrbp1Q99J45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrbp1Q99J45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrbp1Q99J45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nrbp1Q99J45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrbp1Q99J45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrbp1Q99J45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nrbp1Q99J45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrbp1Q99J45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Nrbp1Q99J45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nrbp1Q99J45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrbp1Q99J45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nrbp1Q99J45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrbp1Q99J45 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrbp1Q99J45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nrbp1Q99J45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrbp1Q99J45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms