Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1dQ99246 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1dQ99246 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1dQ99246 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1dQ99246 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1dQ99246 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1dQ99246 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1dQ99246 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1dQ99246 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1dQ99246 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1dQ99246 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1dQ99246 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1dQ99246 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1dQ99246 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1dQ99246 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1dQ99246 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacna1dQ99246 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1dQ99246 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1dQ99246 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1dQ99246 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1dQ99246 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1dQ99246 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1dQ99246 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1dQ99246 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1dQ99246 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1dQ99246 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1dQ99246 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1dQ99246 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1dQ99246 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1dQ99246 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1dQ99246 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1dQ99246 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1dQ99246 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms