Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Trpm2Q91YD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Trpm2Q91YD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Trpm2Q91YD4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Trpm2Q91YD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Trpm2Q91YD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Trpm2Q91YD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Trpm2Q91YD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Trpm2Q91YD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Trpm2Q91YD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Trpm2Q91YD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Trpm2Q91YD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Trpm2Q91YD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Trpm2Q91YD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Trpm2Q91YD4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Trpm2Q91YD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Trpm2Q91YD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Trpm2Q91YD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Trpm2Q91YD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Trpm2Q91YD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Trpm2Q91YD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Trpm2Q91YD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Trpm2Q91YD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Trpm2Q91YD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Trpm2Q91YD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Trpm2Q91YD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Trpm2Q91YD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Trpm2Q91YD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Trpm2Q91YD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Trpm2Q91YD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Trpm2Q91YD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Trpm2Q91YD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Trpm2Q91YD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Trpm2Q91YD4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Trpm2Q91YD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Trpm2Q91YD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Trpm2Q91YD4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Trpm2Q91YD4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Trpm2Q91YD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Trpm2Q91YD4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Trpm2Q91YD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Trpm2Q91YD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Trpm2Q91YD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Trpm2Q91YD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Trpm2Q91YD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Trpm2Q91YD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Trpm2Q91YD4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Trpm2Q91YD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Trpm2Q91YD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Trpm2Q91YD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Trpm2Q91YD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Trpm2Q91YD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trpm2Q91YD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trpm2Q91YD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trpm2Q91YD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Trpm2Q91YD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Trpm2Q91YD4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Trpm2Q91YD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Trpm2Q91YD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Trpm2Q91YD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Trpm2Q91YD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Trpm2Q91YD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Trpm2Q91YD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Trpm2Q91YD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Trpm2Q91YD4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Trpm2Q91YD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Trpm2Q91YD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Trpm2Q91YD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Trpm2Q91YD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Trpm2Q91YD4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Trpm2Q91YD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Trpm2Q91YD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Trpm2Q91YD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Trpm2Q91YD4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trpm2Q91YD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Trpm2Q91YD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Trpm2Q91YD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Trpm2Q91YD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Trpm2Q91YD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Trpm2Q91YD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Trpm2Q91YD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms