Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhac1Q91Y10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhac1Q91Y10 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhac1Q91Y10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhac1Q91Y10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhac1Q91Y10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhac1Q91Y10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhac1Q91Y10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhac1Q91Y10 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhac1Q91Y10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhac1Q91Y10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhac1Q91Y10 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhac1Q91Y10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhac1Q91Y10 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdhac1Q91Y10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdhac1Q91Y10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdhac1Q91Y10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdhac1Q91Y10 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhac1Q91Y10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhac1Q91Y10 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhac1Q91Y10 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhac1Q91Y10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms