Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vsx1Q91V10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vsx1Q91V10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vsx1Q91V10 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vsx1Q91V10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vsx1Q91V10 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vsx1Q91V10 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vsx1Q91V10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vsx1Q91V10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vsx1Q91V10 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vsx1Q91V10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vsx1Q91V10 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vsx1Q91V10 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vsx1Q91V10 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vsx1Q91V10 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vsx1Q91V10 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vsx1Q91V10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vsx1Q91V10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Vsx1Q91V10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vsx1Q91V10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vsx1Q91V10 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vsx1Q91V10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vsx1Q91V10 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vsx1Q91V10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vsx1Q91V10 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vsx1Q91V10 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vsx1Q91V10 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vsx1Q91V10 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vsx1Q91V10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vsx1Q91V10 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Vsx1Q91V10 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vsx1Q91V10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vsx1Q91V10 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vsx1Q91V10 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vsx1Q91V10 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vsx1Q91V10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vsx1Q91V10 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vsx1Q91V10 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vsx1Q91V10 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Vsx1Q91V10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vsx1Q91V10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vsx1Q91V10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vsx1Q91V10 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vsx1Q91V10 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vsx1Q91V10 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vsx1Q91V10 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vsx1Q91V10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms