Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxnQ8VI36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PxnQ8VI36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PxnQ8VI36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PxnQ8VI36 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PxnQ8VI36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PxnQ8VI36 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PxnQ8VI36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PxnQ8VI36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PxnQ8VI36 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PxnQ8VI36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PxnQ8VI36 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PxnQ8VI36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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