Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCY6

Utp6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp6Q8VCY6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Utp6Q8VCY6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Utp6Q8VCY6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp6Q8VCY6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp6Q8VCY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp6Q8VCY6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp6Q8VCY6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp6Q8VCY6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp6Q8VCY6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Utp6Q8VCY6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp6Q8VCY6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp6Q8VCY6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp6Q8VCY6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp6Q8VCY6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp6Q8VCY6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp6Q8VCY6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp6Q8VCY6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Utp6Q8VCY6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp6Q8VCY6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Utp6Q8VCY6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp6Q8VCY6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp6Q8VCY6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp6Q8VCY6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms