Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W5

Tsen15, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen15Q8R3W5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsen15Q8R3W5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsen15Q8R3W5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen15Q8R3W5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen15Q8R3W5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen15Q8R3W5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsen15Q8R3W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsen15Q8R3W5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsen15Q8R3W5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsen15Q8R3W5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsen15Q8R3W5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsen15Q8R3W5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsen15Q8R3W5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsen15Q8R3W5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsen15Q8R3W5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsen15Q8R3W5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsen15Q8R3W5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsen15Q8R3W5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsen15Q8R3W5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsen15Q8R3W5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsen15Q8R3W5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsen15Q8R3W5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsen15Q8R3W5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsen15Q8R3W5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen15Q8R3W5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsen15Q8R3W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsen15Q8R3W5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsen15Q8R3W5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen15Q8R3W5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen15Q8R3W5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms