Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colec12Q8K4Q8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colec12Q8K4Q8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colec12Q8K4Q8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Colec12Q8K4Q8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colec12Q8K4Q8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colec12Q8K4Q8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colec12Q8K4Q8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colec12Q8K4Q8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colec12Q8K4Q8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colec12Q8K4Q8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Colec12Q8K4Q8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Colec12Q8K4Q8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Colec12Q8K4Q8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Colec12Q8K4Q8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Colec12Q8K4Q8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Colec12Q8K4Q8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Colec12Q8K4Q8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Colec12Q8K4Q8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Colec12Q8K4Q8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Colec12Q8K4Q8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Colec12Q8K4Q8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Colec12Q8K4Q8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Colec12Q8K4Q8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Colec12Q8K4Q8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colec12Q8K4Q8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Colec12Q8K4Q8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Colec12Q8K4Q8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Colec12Q8K4Q8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colec12Q8K4Q8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Colec12Q8K4Q8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colec12Q8K4Q8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms