Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F8

Lsm14a, Protein LSM14 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14aQ8K2F8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsm14aQ8K2F8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsm14aQ8K2F8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsm14aQ8K2F8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsm14aQ8K2F8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsm14aQ8K2F8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lsm14aQ8K2F8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lsm14aQ8K2F8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lsm14aQ8K2F8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lsm14aQ8K2F8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lsm14aQ8K2F8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lsm14aQ8K2F8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lsm14aQ8K2F8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lsm14aQ8K2F8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lsm14aQ8K2F8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lsm14aQ8K2F8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lsm14aQ8K2F8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsm14aQ8K2F8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsm14aQ8K2F8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lsm14aQ8K2F8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lsm14aQ8K2F8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsm14aQ8K2F8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lsm14aQ8K2F8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lsm14aQ8K2F8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsm14aQ8K2F8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsm14aQ8K2F8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lsm14aQ8K2F8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsm14aQ8K2F8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms