Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neil3Q8K203 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Neil3Q8K203 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Neil3Q8K203 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neil3Q8K203 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neil3Q8K203 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neil3Q8K203 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neil3Q8K203 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neil3Q8K203 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neil3Q8K203 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neil3Q8K203 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neil3Q8K203 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neil3Q8K203 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neil3Q8K203 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neil3Q8K203 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neil3Q8K203 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neil3Q8K203 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neil3Q8K203 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neil3Q8K203 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neil3Q8K203 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Neil3Q8K203 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neil3Q8K203 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neil3Q8K203 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neil3Q8K203 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neil3Q8K203 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neil3Q8K203 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms