Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1N2

Phldb2, Pleckstrin homology-like domain family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb2Q8K1N2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Phldb2Q8K1N2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Phldb2Q8K1N2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Phldb2Q8K1N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Phldb2Q8K1N2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Phldb2Q8K1N2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Phldb2Q8K1N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Phldb2Q8K1N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Phldb2Q8K1N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Phldb2Q8K1N2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Phldb2Q8K1N2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Phldb2Q8K1N2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Phldb2Q8K1N2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Phldb2Q8K1N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Phldb2Q8K1N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Phldb2Q8K1N2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Phldb2Q8K1N2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Phldb2Q8K1N2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Phldb2Q8K1N2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Phldb2Q8K1N2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Phldb2Q8K1N2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Phldb2Q8K1N2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Phldb2Q8K1N2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Phldb2Q8K1N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Phldb2Q8K1N2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
Phldb2Q8K1N2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Phldb2Q8K1N2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Phldb2Q8K1N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Phldb2Q8K1N2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Phldb2Q8K1N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Phldb2Q8K1N2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Phldb2Q8K1N2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Phldb2Q8K1N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Phldb2Q8K1N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Phldb2Q8K1N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Phldb2Q8K1N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Phldb2Q8K1N2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phldb2Q8K1N2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Phldb2Q8K1N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phldb2Q8K1N2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Phldb2Q8K1N2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms