Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgef1bQ8JZL7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgef1bQ8JZL7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1bQ8JZL7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1bQ8JZL7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1bQ8JZL7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgef1bQ8JZL7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1bQ8JZL7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1bQ8JZL7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasgef1bQ8JZL7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasgef1bQ8JZL7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1bQ8JZL7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms