Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc43a2Q8CGA3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc43a2Q8CGA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc43a2Q8CGA3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc43a2Q8CGA3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc43a2Q8CGA3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc43a2Q8CGA3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc43a2Q8CGA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc43a2Q8CGA3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc43a2Q8CGA3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc43a2Q8CGA3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc43a2Q8CGA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc43a2Q8CGA3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc43a2Q8CGA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc43a2Q8CGA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc43a2Q8CGA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc43a2Q8CGA3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc43a2Q8CGA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc43a2Q8CGA3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc43a2Q8CGA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc43a2Q8CGA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc43a2Q8CGA3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc43a2Q8CGA3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc43a2Q8CGA3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc43a2Q8CGA3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc43a2Q8CGA3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc43a2Q8CGA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc43a2Q8CGA3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc43a2Q8CGA3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc43a2Q8CGA3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms