Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx8Q8CFD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx8Q8CFD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx8Q8CFD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx8Q8CFD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Snx8Q8CFD4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx8Q8CFD4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx8Q8CFD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx8Q8CFD4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx8Q8CFD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx8Q8CFD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx8Q8CFD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx8Q8CFD4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx8Q8CFD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx8Q8CFD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx8Q8CFD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx8Q8CFD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx8Q8CFD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx8Q8CFD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx8Q8CFD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx8Q8CFD4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx8Q8CFD4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx8Q8CFD4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx8Q8CFD4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx8Q8CFD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx8Q8CFD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx8Q8CFD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx8Q8CFD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx8Q8CFD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx8Q8CFD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx8Q8CFD4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx8Q8CFD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx8Q8CFD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx8Q8CFD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx8Q8CFD4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx8Q8CFD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx8Q8CFD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx8Q8CFD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx8Q8CFD4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx8Q8CFD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms