Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc73Q8CDM4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc73Q8CDM4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc73Q8CDM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ccdc73Q8CDM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc73Q8CDM4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc73Q8CDM4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc73Q8CDM4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc73Q8CDM4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc73Q8CDM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc73Q8CDM4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc73Q8CDM4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc73Q8CDM4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc73Q8CDM4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc73Q8CDM4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc73Q8CDM4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc73Q8CDM4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc73Q8CDM4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc73Q8CDM4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc73Q8CDM4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc73Q8CDM4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc73Q8CDM4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc73Q8CDM4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc73Q8CDM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc73Q8CDM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc73Q8CDM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc73Q8CDM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc73Q8CDM4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc73Q8CDM4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc73Q8CDM4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc73Q8CDM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc73Q8CDM4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc73Q8CDM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc73Q8CDM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc73Q8CDM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc73Q8CDM4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc73Q8CDM4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc73Q8CDM4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc73Q8CDM4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc73Q8CDM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc73Q8CDM4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms