Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc87Q8CDL9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc87Q8CDL9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc87Q8CDL9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc87Q8CDL9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc87Q8CDL9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc87Q8CDL9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc87Q8CDL9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc87Q8CDL9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc87Q8CDL9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc87Q8CDL9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc87Q8CDL9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc87Q8CDL9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc87Q8CDL9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc87Q8CDL9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc87Q8CDL9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc87Q8CDL9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc87Q8CDL9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc87Q8CDL9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc87Q8CDL9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc87Q8CDL9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc87Q8CDL9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc87Q8CDL9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc87Q8CDL9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc87Q8CDL9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc87Q8CDL9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc87Q8CDL9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms