Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nsun3Q8CCT7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsun3Q8CCT7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nsun3Q8CCT7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsun3Q8CCT7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsun3Q8CCT7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsun3Q8CCT7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsun3Q8CCT7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nsun3Q8CCT7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nsun3Q8CCT7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nsun3Q8CCT7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nsun3Q8CCT7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsun3Q8CCT7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsun3Q8CCT7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsun3Q8CCT7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsun3Q8CCT7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsun3Q8CCT7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsun3Q8CCT7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsun3Q8CCT7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsun3Q8CCT7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsun3Q8CCT7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsun3Q8CCT7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsun3Q8CCT7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsun3Q8CCT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsun3Q8CCT7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nsun3Q8CCT7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsun3Q8CCT7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsun3Q8CCT7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nsun3Q8CCT7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsun3Q8CCT7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsun3Q8CCT7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsun3Q8CCT7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsun3Q8CCT7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsun3Q8CCT7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms