Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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4933409G03RikQ8C5U0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4933409G03RikQ8C5U0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4933409G03RikQ8C5U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933409G03RikQ8C5U0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
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4933409G03RikQ8C5U0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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4933409G03RikQ8C5U0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
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4933409G03RikQ8C5U0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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4933409G03RikQ8C5U0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4933409G03RikQ8C5U0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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4933409G03RikQ8C5U0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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4933409G03RikQ8C5U0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933409G03RikQ8C5U0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
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4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4933409G03RikQ8C5U0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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4933409G03RikQ8C5U0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
4933409G03RikQ8C5U0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4933409G03RikQ8C5U0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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4933409G03RikQ8C5U0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
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4933409G03RikQ8C5U0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4933409G03RikQ8C5U0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933409G03RikQ8C5U0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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4933409G03RikQ8C5U0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
4933409G03RikQ8C5U0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
4933409G03RikQ8C5U0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933409G03RikQ8C5U0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933409G03RikQ8C5U0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
4933409G03RikQ8C5U0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
4933409G03RikQ8C5U0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4933409G03RikQ8C5U0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4933409G03RikQ8C5U0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
4933409G03RikQ8C5U0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933409G03RikQ8C5U0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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