Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1P2

Defa21, Alpha-defensin 21, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa21Q8C1P2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa21Q8C1P2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa21Q8C1P2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa21Q8C1P2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa21Q8C1P2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa21Q8C1P2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa21Q8C1P2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa21Q8C1P2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa21Q8C1P2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms