Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim35Q8C006 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim35Q8C006 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim35Q8C006 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim35Q8C006 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim35Q8C006 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim35Q8C006 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim35Q8C006 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim35Q8C006 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim35Q8C006 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim35Q8C006 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim35Q8C006 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim35Q8C006 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim35Q8C006 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim35Q8C006 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim35Q8C006 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim35Q8C006 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim35Q8C006 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim35Q8C006 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim35Q8C006 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim35Q8C006 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim35Q8C006 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim35Q8C006 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim35Q8C006 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim35Q8C006 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim35Q8C006 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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