Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc30Q8BVF4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc30Q8BVF4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc30Q8BVF4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc30Q8BVF4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc30Q8BVF4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc30Q8BVF4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc30Q8BVF4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc30Q8BVF4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc30Q8BVF4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc30Q8BVF4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc30Q8BVF4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc30Q8BVF4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc30Q8BVF4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc30Q8BVF4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc30Q8BVF4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc30Q8BVF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc30Q8BVF4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc30Q8BVF4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc30Q8BVF4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc30Q8BVF4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc30Q8BVF4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc30Q8BVF4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc30Q8BVF4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc30Q8BVF4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc30Q8BVF4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc30Q8BVF4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc30Q8BVF4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc30Q8BVF4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc30Q8BVF4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc30Q8BVF4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc30Q8BVF4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc30Q8BVF4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc30Q8BVF4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc30Q8BVF4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc30Q8BVF4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc30Q8BVF4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc30Q8BVF4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc30Q8BVF4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc30Q8BVF4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc30Q8BVF4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc30Q8BVF4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc30Q8BVF4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc30Q8BVF4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc30Q8BVF4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc30Q8BVF4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc30Q8BVF4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc30Q8BVF4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc30Q8BVF4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc30Q8BVF4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc30Q8BVF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc30Q8BVF4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc30Q8BVF4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc30Q8BVF4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc30Q8BVF4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc30Q8BVF4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc30Q8BVF4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc30Q8BVF4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc30Q8BVF4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms