Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PcgF3Q8BTQ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PcgF3Q8BTQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcgF3Q8BTQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PcgF3Q8BTQ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PcgF3Q8BTQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcgF3Q8BTQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PcgF3Q8BTQ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PcgF3Q8BTQ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PcgF3Q8BTQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcgF3Q8BTQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcgF3Q8BTQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcgF3Q8BTQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PcgF3Q8BTQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PcgF3Q8BTQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PcgF3Q8BTQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PcgF3Q8BTQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PcgF3Q8BTQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PcgF3Q8BTQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PcgF3Q8BTQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms