Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf3c4Q8BMQ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c4Q8BMQ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c4Q8BMQ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf3c4Q8BMQ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf3c4Q8BMQ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c4Q8BMQ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c4Q8BMQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf3c4Q8BMQ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf3c4Q8BMQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c4Q8BMQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c4Q8BMQ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c4Q8BMQ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c4Q8BMQ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c4Q8BMQ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c4Q8BMQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c4Q8BMQ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c4Q8BMQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c4Q8BMQ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c4Q8BMQ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c4Q8BMQ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c4Q8BMQ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c4Q8BMQ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c4Q8BMQ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c4Q8BMQ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c4Q8BMQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms