Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fbxo38Q8BMI0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fbxo38Q8BMI0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fbxo38Q8BMI0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fbxo38Q8BMI0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fbxo38Q8BMI0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fbxo38Q8BMI0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fbxo38Q8BMI0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fbxo38Q8BMI0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo38Q8BMI0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fbxo38Q8BMI0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fbxo38Q8BMI0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fbxo38Q8BMI0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo38Q8BMI0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo38Q8BMI0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo38Q8BMI0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo38Q8BMI0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo38Q8BMI0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fbxo38Q8BMI0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbxo38Q8BMI0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fbxo38Q8BMI0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fbxo38Q8BMI0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fbxo38Q8BMI0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fbxo38Q8BMI0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fbxo38Q8BMI0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fbxo38Q8BMI0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fbxo38Q8BMI0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbxo38Q8BMI0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fbxo38Q8BMI0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fbxo38Q8BMI0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fbxo38Q8BMI0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fbxo38Q8BMI0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fbxo38Q8BMI0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fbxo38Q8BMI0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fbxo38Q8BMI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fbxo38Q8BMI0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms