Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmd4aQ8BIE6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmd4aQ8BIE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmd4aQ8BIE6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmd4aQ8BIE6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmd4aQ8BIE6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmd4aQ8BIE6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Frmd4aQ8BIE6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmd4aQ8BIE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmd4aQ8BIE6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmd4aQ8BIE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmd4aQ8BIE6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmd4aQ8BIE6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmd4aQ8BIE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmd4aQ8BIE6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmd4aQ8BIE6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmd4aQ8BIE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmd4aQ8BIE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmd4aQ8BIE6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmd4aQ8BIE6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmd4aQ8BIE6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmd4aQ8BIE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmd4aQ8BIE6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmd4aQ8BIE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmd4aQ8BIE6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmd4aQ8BIE6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmd4aQ8BIE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmd4aQ8BIE6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmd4aQ8BIE6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmd4aQ8BIE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Frmd4aQ8BIE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Frmd4aQ8BIE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmd4aQ8BIE6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frmd4aQ8BIE6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmd4aQ8BIE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.6 ms