Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Depdc1bQ8BH88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Depdc1bQ8BH88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Depdc1bQ8BH88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Depdc1bQ8BH88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc1bQ8BH88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc1bQ8BH88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Depdc1bQ8BH88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc1bQ8BH88 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Depdc1bQ8BH88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Depdc1bQ8BH88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc1bQ8BH88 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Depdc1bQ8BH88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Depdc1bQ8BH88 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc1bQ8BH88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc1bQ8BH88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc1bQ8BH88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc1bQ8BH88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Depdc1bQ8BH88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Depdc1bQ8BH88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Depdc1bQ8BH88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc1bQ8BH88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc1bQ8BH88 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc1bQ8BH88 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Depdc1bQ8BH88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Depdc1bQ8BH88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Depdc1bQ8BH88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Depdc1bQ8BH88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Depdc1bQ8BH88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc1bQ8BH88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc1bQ8BH88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Depdc1bQ8BH88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Depdc1bQ8BH88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Depdc1bQ8BH88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Depdc1bQ8BH88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc1bQ8BH88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc1bQ8BH88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc1bQ8BH88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc1bQ8BH88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc1bQ8BH88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc1bQ8BH88 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc1bQ8BH88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc1bQ8BH88 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Depdc1bQ8BH88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc1bQ8BH88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc1bQ8BH88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms