Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx32Q80ZJ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx32Q80ZJ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx32Q80ZJ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx32Q80ZJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx32Q80ZJ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx32Q80ZJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx32Q80ZJ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx32Q80ZJ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx32Q80ZJ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx32Q80ZJ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx32Q80ZJ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx32Q80ZJ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx32Q80ZJ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx32Q80ZJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx32Q80ZJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx32Q80ZJ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx32Q80ZJ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx32Q80ZJ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx32Q80ZJ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx32Q80ZJ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx32Q80ZJ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx32Q80ZJ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx32Q80ZJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx32Q80ZJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx32Q80ZJ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx32Q80ZJ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx32Q80ZJ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx32Q80ZJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx32Q80ZJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx32Q80ZJ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms