Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrsam1Q80ZI6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lrsam1Q80ZI6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrsam1Q80ZI6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrsam1Q80ZI6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrsam1Q80ZI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lrsam1Q80ZI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrsam1Q80ZI6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrsam1Q80ZI6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrsam1Q80ZI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrsam1Q80ZI6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrsam1Q80ZI6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrsam1Q80ZI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrsam1Q80ZI6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrsam1Q80ZI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrsam1Q80ZI6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrsam1Q80ZI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrsam1Q80ZI6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrsam1Q80ZI6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrsam1Q80ZI6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrsam1Q80ZI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrsam1Q80ZI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrsam1Q80ZI6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrsam1Q80ZI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrsam1Q80ZI6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrsam1Q80ZI6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrsam1Q80ZI6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrsam1Q80ZI6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lrsam1Q80ZI6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrsam1Q80ZI6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrsam1Q80ZI6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrsam1Q80ZI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrsam1Q80ZI6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrsam1Q80ZI6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms