Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2bQ80XK6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2bQ80XK6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2bQ80XK6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg2bQ80XK6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg2bQ80XK6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg2bQ80XK6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg2bQ80XK6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg2bQ80XK6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg2bQ80XK6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg2bQ80XK6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atg2bQ80XK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg2bQ80XK6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg2bQ80XK6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg2bQ80XK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg2bQ80XK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg2bQ80XK6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg2bQ80XK6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg2bQ80XK6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg2bQ80XK6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg2bQ80XK6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg2bQ80XK6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg2bQ80XK6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg2bQ80XK6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg2bQ80XK6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg2bQ80XK6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg2bQ80XK6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg2bQ80XK6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg2bQ80XK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg2bQ80XK6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg2bQ80XK6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg2bQ80XK6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg2bQ80XK6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg2bQ80XK6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg2bQ80XK6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg2bQ80XK6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg2bQ80XK6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg2bQ80XK6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms