Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sdccag8Q80UF4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sdccag8Q80UF4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sdccag8Q80UF4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sdccag8Q80UF4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sdccag8Q80UF4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sdccag8Q80UF4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Sdccag8Q80UF4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sdccag8Q80UF4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sdccag8Q80UF4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sdccag8Q80UF4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sdccag8Q80UF4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sdccag8Q80UF4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sdccag8Q80UF4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sdccag8Q80UF4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sdccag8Q80UF4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sdccag8Q80UF4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sdccag8Q80UF4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sdccag8Q80UF4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sdccag8Q80UF4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sdccag8Q80UF4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sdccag8Q80UF4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sdccag8Q80UF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sdccag8Q80UF4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sdccag8Q80UF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sdccag8Q80UF4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms