Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl29Q80T74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhl29Q80T74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl29Q80T74 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl29Q80T74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl29Q80T74 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl29Q80T74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl29Q80T74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl29Q80T74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl29Q80T74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl29Q80T74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl29Q80T74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl29Q80T74 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl29Q80T74 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl29Q80T74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl29Q80T74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl29Q80T74 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Klhl29Q80T74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl29Q80T74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl29Q80T74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl29Q80T74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klhl29Q80T74 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl29Q80T74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms