Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ07

Poln, DNA polymerase nu, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolnQ7TQ07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PolnQ7TQ07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PolnQ7TQ07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PolnQ7TQ07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PolnQ7TQ07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PolnQ7TQ07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PolnQ7TQ07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PolnQ7TQ07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PolnQ7TQ07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PolnQ7TQ07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PolnQ7TQ07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PolnQ7TQ07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PolnQ7TQ07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PolnQ7TQ07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PolnQ7TQ07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PolnQ7TQ07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PolnQ7TQ07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PolnQ7TQ07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PolnQ7TQ07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PolnQ7TQ07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PolnQ7TQ07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PolnQ7TQ07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PolnQ7TQ07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PolnQ7TQ07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PolnQ7TQ07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PolnQ7TQ07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PolnQ7TQ07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PolnQ7TQ07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PolnQ7TQ07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PolnQ7TQ07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PolnQ7TQ07 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PolnQ7TQ07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PolnQ7TQ07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PolnQ7TQ07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PolnQ7TQ07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PolnQ7TQ07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PolnQ7TQ07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PolnQ7TQ07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PolnQ7TQ07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolnQ7TQ07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolnQ7TQ07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolnQ7TQ07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PolnQ7TQ07 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PolnQ7TQ07 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PolnQ7TQ07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolnQ7TQ07 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolnQ7TQ07 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PolnQ7TQ07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolnQ7TQ07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolnQ7TQ07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolnQ7TQ07 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms