Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg5Q6ZPY2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg5Q6ZPY2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg5Q6ZPY2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smg5Q6ZPY2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg5Q6ZPY2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg5Q6ZPY2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smg5Q6ZPY2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg5Q6ZPY2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smg5Q6ZPY2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Smg5Q6ZPY2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smg5Q6ZPY2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Smg5Q6ZPY2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg5Q6ZPY2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg5Q6ZPY2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg5Q6ZPY2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smg5Q6ZPY2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smg5Q6ZPY2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg5Q6ZPY2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smg5Q6ZPY2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smg5Q6ZPY2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smg5Q6ZPY2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smg5Q6ZPY2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smg5Q6ZPY2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smg5Q6ZPY2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smg5Q6ZPY2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smg5Q6ZPY2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg5Q6ZPY2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smg5Q6ZPY2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg5Q6ZPY2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg5Q6ZPY2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms