Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hsh2dQ6VYH9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hsh2dQ6VYH9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hsh2dQ6VYH9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hsh2dQ6VYH9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hsh2dQ6VYH9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hsh2dQ6VYH9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hsh2dQ6VYH9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hsh2dQ6VYH9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hsh2dQ6VYH9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hsh2dQ6VYH9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hsh2dQ6VYH9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hsh2dQ6VYH9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hsh2dQ6VYH9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hsh2dQ6VYH9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hsh2dQ6VYH9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hsh2dQ6VYH9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hsh2dQ6VYH9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hsh2dQ6VYH9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hsh2dQ6VYH9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms