Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Ift172Q6VH22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ift172Q6VH22 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ift172Q6VH22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ift172Q6VH22 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ift172Q6VH22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift172Q6VH22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ift172Q6VH22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ift172Q6VH22 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ift172Q6VH22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ift172Q6VH22 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Ift172Q6VH22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ift172Q6VH22 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ift172Q6VH22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ift172Q6VH22 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ift172Q6VH22 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ift172Q6VH22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ift172Q6VH22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ift172Q6VH22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ift172Q6VH22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ift172Q6VH22 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ift172Q6VH22 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ift172Q6VH22 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ift172Q6VH22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ift172Q6VH22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ift172Q6VH22 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ift172Q6VH22 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ift172Q6VH22 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ift172Q6VH22 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ift172Q6VH22 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ift172Q6VH22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ift172Q6VH22 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ift172Q6VH22 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ift172Q6VH22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ift172Q6VH22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ift172Q6VH22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ift172Q6VH22 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ift172Q6VH22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ift172Q6VH22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ift172Q6VH22 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ift172Q6VH22 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ift172Q6VH22 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ift172Q6VH22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ift172Q6VH22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ift172Q6VH22 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ift172Q6VH22 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ift172Q6VH22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ift172Q6VH22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ift172Q6VH22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ift172Q6VH22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift172Q6VH22 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ift172Q6VH22 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ift172Q6VH22 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift172Q6VH22 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ift172Q6VH22 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ift172Q6VH22 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ift172Q6VH22 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms