Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdk2Q6V4S5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sdk2Q6V4S5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdk2Q6V4S5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdk2Q6V4S5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdk2Q6V4S5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdk2Q6V4S5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdk2Q6V4S5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdk2Q6V4S5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdk2Q6V4S5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdk2Q6V4S5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdk2Q6V4S5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdk2Q6V4S5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sdk2Q6V4S5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdk2Q6V4S5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdk2Q6V4S5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdk2Q6V4S5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdk2Q6V4S5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdk2Q6V4S5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sdk2Q6V4S5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sdk2Q6V4S5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sdk2Q6V4S5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sdk2Q6V4S5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdk2Q6V4S5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdk2Q6V4S5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sdk2Q6V4S5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdk2Q6V4S5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdk2Q6V4S5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdk2Q6V4S5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdk2Q6V4S5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdk2Q6V4S5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdk2Q6V4S5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdk2Q6V4S5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdk2Q6V4S5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdk2Q6V4S5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdk2Q6V4S5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdk2Q6V4S5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdk2Q6V4S5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdk2Q6V4S5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdk2Q6V4S5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdk2Q6V4S5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms