Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Chd4Q6PDQ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Chd4Q6PDQ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Chd4Q6PDQ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Chd4Q6PDQ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Chd4Q6PDQ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Chd4Q6PDQ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd4Q6PDQ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Chd4Q6PDQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Chd4Q6PDQ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Chd4Q6PDQ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Chd4Q6PDQ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Chd4Q6PDQ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Chd4Q6PDQ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Chd4Q6PDQ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Chd4Q6PDQ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Chd4Q6PDQ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Chd4Q6PDQ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Chd4Q6PDQ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Chd4Q6PDQ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Chd4Q6PDQ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Chd4Q6PDQ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Chd4Q6PDQ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Chd4Q6PDQ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Chd4Q6PDQ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Chd4Q6PDQ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Chd4Q6PDQ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Chd4Q6PDQ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Chd4Q6PDQ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Chd4Q6PDQ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Chd4Q6PDQ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Chd4Q6PDQ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Chd4Q6PDQ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Chd4Q6PDQ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Chd4Q6PDQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Chd4Q6PDQ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Chd4Q6PDQ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Chd4Q6PDQ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Chd4Q6PDQ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Chd4Q6PDQ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Chd4Q6PDQ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Chd4Q6PDQ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Chd4Q6PDQ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Chd4Q6PDQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chd4Q6PDQ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Chd4Q6PDQ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Chd4Q6PDQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Chd4Q6PDQ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Chd4Q6PDQ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Chd4Q6PDQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Chd4Q6PDQ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Chd4Q6PDQ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Chd4Q6PDQ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms