Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn7Q6P5G6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn7Q6P5G6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn7Q6P5G6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn7Q6P5G6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn7Q6P5G6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn7Q6P5G6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn7Q6P5G6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ubxn7Q6P5G6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn7Q6P5G6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn7Q6P5G6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn7Q6P5G6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn7Q6P5G6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn7Q6P5G6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn7Q6P5G6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn7Q6P5G6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn7Q6P5G6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn7Q6P5G6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn7Q6P5G6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn7Q6P5G6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn7Q6P5G6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn7Q6P5G6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 980.9 ms