Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcn12Q6JVL5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcn12Q6JVL5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lcn12Q6JVL5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcn12Q6JVL5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcn12Q6JVL5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcn12Q6JVL5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lcn12Q6JVL5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn12Q6JVL5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcn12Q6JVL5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn12Q6JVL5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn12Q6JVL5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn12Q6JVL5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn12Q6JVL5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcn12Q6JVL5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn12Q6JVL5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn12Q6JVL5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn12Q6JVL5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn12Q6JVL5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn12Q6JVL5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn12Q6JVL5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn12Q6JVL5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn12Q6JVL5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn12Q6JVL5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn12Q6JVL5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lcn12Q6JVL5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn12Q6JVL5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lcn12Q6JVL5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn12Q6JVL5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn12Q6JVL5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms