Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Nckap5lQ6GQX2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nckap5lQ6GQX2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Nckap5lQ6GQX2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nckap5lQ6GQX2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nckap5lQ6GQX2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Nckap5lQ6GQX2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nckap5lQ6GQX2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nckap5lQ6GQX2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nckap5lQ6GQX2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nckap5lQ6GQX2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nckap5lQ6GQX2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nckap5lQ6GQX2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nckap5lQ6GQX2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nckap5lQ6GQX2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Nckap5lQ6GQX2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Nckap5lQ6GQX2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nckap5lQ6GQX2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nckap5lQ6GQX2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nckap5lQ6GQX2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Nckap5lQ6GQX2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nckap5lQ6GQX2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nckap5lQ6GQX2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nckap5lQ6GQX2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nckap5lQ6GQX2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Nckap5lQ6GQX2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nckap5lQ6GQX2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nckap5lQ6GQX2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nckap5lQ6GQX2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nckap5lQ6GQX2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Nckap5lQ6GQX2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nckap5lQ6GQX2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Nckap5lQ6GQX2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Nckap5lQ6GQX2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Nckap5lQ6GQX2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Nckap5lQ6GQX2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Nckap5lQ6GQX2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Nckap5lQ6GQX2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nckap5lQ6GQX2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nckap5lQ6GQX2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nckap5lQ6GQX2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Nckap5lQ6GQX2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Nckap5lQ6GQX2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Nckap5lQ6GQX2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Nckap5lQ6GQX2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nckap5lQ6GQX2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nckap5lQ6GQX2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nckap5lQ6GQX2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Nckap5lQ6GQX2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nckap5lQ6GQX2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nckap5lQ6GQX2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nckap5lQ6GQX2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Nckap5lQ6GQX2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nckap5lQ6GQX2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nckap5lQ6GQX2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Nckap5lQ6GQX2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nckap5lQ6GQX2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Nckap5lQ6GQX2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nckap5lQ6GQX2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Nckap5lQ6GQX2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Nckap5lQ6GQX2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nckap5lQ6GQX2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nckap5lQ6GQX2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nckap5lQ6GQX2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nckap5lQ6GQX2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nckap5lQ6GQX2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nckap5lQ6GQX2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Nckap5lQ6GQX2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nckap5lQ6GQX2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms