Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp4eQ66X19 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp4eQ66X19 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp4eQ66X19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp4eQ66X19 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp4eQ66X19 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp4eQ66X19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp4eQ66X19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp4eQ66X19 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp4eQ66X19 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4eQ66X19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlrp4eQ66X19 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlrp4eQ66X19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp4eQ66X19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp4eQ66X19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp4eQ66X19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp4eQ66X19 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp4eQ66X19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp4eQ66X19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4eQ66X19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp4eQ66X19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp4eQ66X19 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4eQ66X19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4eQ66X19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms