Protein–RNA interactions for Protein: Q64707

Zrsr1, U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor 35 kDa subunit-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zrsr1Q64707 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zrsr1Q64707 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zrsr1Q64707 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zrsr1Q64707 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zrsr1Q64707 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zrsr1Q64707 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zrsr1Q64707 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zrsr1Q64707 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zrsr1Q64707 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zrsr1Q64707 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zrsr1Q64707 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zrsr1Q64707 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zrsr1Q64707 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zrsr1Q64707 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zrsr1Q64707 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms