Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou4f3Q63955 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou4f3Q63955 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou4f3Q63955 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou4f3Q63955 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pou4f3Q63955 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pou4f3Q63955 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pou4f3Q63955 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pou4f3Q63955 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou4f3Q63955 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou4f3Q63955 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pou4f3Q63955 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou4f3Q63955 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou4f3Q63955 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou4f3Q63955 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou4f3Q63955 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou4f3Q63955 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou4f3Q63955 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms